受到名間強震的影響，高鐵及台鐵受到不同程度的影響，高鐵台中以南區間列車全面停駛一個半小時，晚間七點起，除了已經在路線上的列車恢復行駛之外，每小時僅維持兩班「站站停」列車發車行駛，其他直達列車取消，估計受影響班次超過30班以上，部分列車誤點超過一小時以上，大量旅客被滯留在各地車站，抱怨不已。
由於地震屬於不可抗力的天災，因此誤點不賠償。


至於台鐵的部分，台鐵表示：根據各地車站觀測的震度約四級，因此依照規定，第一趟列車以時速30公里慢速前進，第二趟列車恢復到60公里，逐漸恢復運轉速度，總計受影響共21列次，慢分約408分。
不過，二水～田中間，一處電車線三角鐵架，受地震搖動鬆脫，墜落卡在第3820列次「車埕到台中」的列車車頂上，列車停駛。
台鐵安排旅客疏散改搭28列次繼續行程，目前田中二水間，維持單線雙向運轉。


高鐵公司表示：傍晚南投地區發生地震之後，台中以南各次列車就地暫停，晚間七點過後，各次列車逐漸恢復慢行。
晚間七點起，南下北上列車恢復少量運轉：台中往南列車，從晚間七點零六分起，第471列次開始恢復發車運轉，台北往南列車，從晚間八點零六分，第483列次開始恢復發車。
北上部分，左營站從晚間七點三十六分，第482列次恢復發車。


但因受列車調度的影響，再加上必須消化延誤的班次，高鐵公司晚間也緊急決定，每個小時維持兩個班次的「站站停」模式運轉的列車，其他班次取消，多數都是直達列車，估計至少取消十班，受影響列車超過30列次。
其中，第459南下列車抵達左營站時，延誤一個小時十七分。