台東縣出現第一起豬隻被人類傳染新流感的案件，有學者擔心病毒可能在豬的身上產生變異再回傳給人，到時候情況就嚴重了，因此建議政府把豬農列為優先施打疫苗的對象；不過疾管局判斷威脅並不大，因此決定不去更動疫苗的施打順序。

新流感疫苗在災民和第一線醫護人員都施打了之後，下星期一9號，輪到六個月到一歲的嬰兒接種了。

十月份也有接種季節流感的民眾，也能同時接種新流感疫苗，兩者不會互相衝突。由於昨天在台東有養豬場爆發人傳豬的新流感疫情， 有學者擔心流感病毒可能基因重組又回傳給人，建議將豬農也列為疫苗的優先接種對象。

前SARS研究團隊主持人、成大校長賴明詔認為，即使豬流感基因重組再回傳給人，威脅也不大。

不過賴明詔強調，如果人流感傳到禽類再回傳給人的話，結果將不堪設想，致死率至少三成。幸好流感基因重組演化成新型病毒也要一段時間，病毒強度也會隨時間減弱，加上禽流感傳播力極低，過去十年來，人類死於禽流感只有零星個案，造成大規模傳染機率低，民眾不用太過擔心。