海基會6日晚間宣布，海峽兩岸今日正式建立食品安全聯繫窗口。海基會說，已於今日上午依據主管機關囑託函告大陸海協會，我方指定行政院衛生署食品衛生處以及經濟部標準檢驗局實際業務主管，擔任兩岸食品衛生主管部門間緊急事件直接通報聯繫窗口。

海協會在回覆海基會的信函中也告知，大陸方面指定衛生部衛生監督局和質量監督檢驗檢疫總局進出口食品安全局相同層級人員為聯繫之窗口。

海基會表示，大陸爆發三聚氰胺污染奶製品事件後，引起國人高度關注，我方食品衛生專家團9月底赴大陸溝通，並與大陸相關主管機關代表、專家座談，盼透過兩岸兩會之聯繫，能盡速建立兩岸貿易商品檢驗及衛生主管部門的直接聯繫管道與即時通報系統，以有效維護民眾健康權益。

海基會說，目前兩岸主管部門已指定並確認聯繫窗口，日後涉及兩岸食品衛生安全相關事項之重大訊息、處置措施、相互協助事項，需緊急通報對方時，即可透過此一緊急聯繫窗口直接通報。

海基會還說，日後兩岸食品衛生安全緊急重大事宜的通報，除了透過此一聯繫窗口外，海基會與海協會原有的通報機制，仍將維持既有的功能，就相關的緊急案件做同步的通報，以保證相關案件能及時、有效地傳送與處理。