新流感疫情升溫，而國人自治的新流感疫苗再過9天，就能提供國人注射使用。對此，馬英九總統7日在出席第102屆台灣醫學會總會暨2009年台灣醫學週-台灣聯合醫學會學術演講會時，公開肯定，「台灣能自製新流感疫苗，是我們國家地位，非常重要的提昇」。馬總統說：『（原音）我們就要打國光疫苗，國光疫苗各位都知道已經做過人體實驗，4家醫學中心檢驗的結果，它的效能非常好，絕對不會輸給外國疫苗，這一點我們自製疫苗這一點，也許一般人還沒有感覺到，我感覺到了，這是我們國家地位一個重要的提昇。』至於對行政院長吳敦義，陷入與過去曾槍殺縣議員的「更生人」江欽良同遊的峇里島的風波，馬總統則沒有任何公開的回應。