新流感疫情升溫,而國人自治的新流感疫苗再過9天,就能提供國人注射使用。對此,馬英九總統7日在出席第102屆台灣醫學會總會暨2009年台灣醫學週-台灣聯合醫學會學術演講會時,公開肯定,「台灣能自製新流感疫苗,是我們國家地位,非常重要的提昇」。馬總統說:『(原音)我們就要打國光疫苗,國光疫苗各位都知道已經做過人體實驗,4家醫學中心檢驗的結果,它的效能非常好,絕對不會輸給外國疫苗,這一點我們自製疫苗這一點,也許一般人還沒有感覺到,我感覺到了,這是我們國家地位一個重要的提昇。』至於對行政院長吳敦義,陷入與過去曾槍殺縣議員的「更生人」江欽良同遊的峇里島的風波,馬總統則沒有任何公開的回應。